牙齿矫正后患者可能会出现牙釉质脱矿这一后遗症，患者使用矫正装置的时候可能会导致佩戴矫正器的部位清洁不到位，牙齿表面出现不可逆的脱矿，部分患者还会诱发龋齿。其次牙齿矫正后还可能会出现牙周组织损坏、牙根吸收、黏膜溃疡以及牙髓反应等后遗症。长期进行牙齿矫正的时候可能会导致上牙和下牙的咬合关系不好，从而出现咀嚼功能下降以及营养吸收不足等危害。