两个肩胛骨中间很疼的原因有以下几种情况：1、肩颈韧带发生损伤或长时间姿势不正确，肩部受累引发的疼痛，在医生的指导下，学习正规的肩颈部的拉伸运动操，以及注意间断性的调整姿势，从而增加血液循环，减轻疼痛；2、可能跟颈椎病、肩周炎有关，及时医院就诊，对症治疗等；3、可能跟风湿疾病有关，关节发生病变或者机体发生免疫力下降引起的，遵医嘱给予抗风湿性药物治疗。