月经总是长时间不干净可能是由于子宫肌瘤、子宫内膜炎、子宫内膜息肉以及宫颈炎等疾病所致，或者是体内的激素出现紊乱引起，建议您入院进行性激素六项检查以及子宫彩超检查。如果确诊为子宫内膜炎引起，则可能是病原体感染、不洁的性生活以及下生殖道感染等因素诱发，临床上以头孢菌素以及甲硝唑药物治疗为主，这种药物主要以口服、肌注以及静脉滴注治疗为主。