眼部扁平疣可以进行激光治疗，激光治疗后局部不容易出现疤痕印记。另外还可以给患者口服左旋咪唑片、转移因子胶囊等药物治疗，与此同时，还要在患处涂干扰素软膏、咪喹莫特乳膏治疗。建议进行激光治疗后一个星期之内，不能使用刺激性大的去角质产品，也不能用手抠局部，要保持局部清洁干燥，避免出现感染。外出的时候，还要注意防晒，还要避免摩擦或挤压患处。