膦甲酸钠氯化钠在临床上一般用于治疗巨细胞病毒性视网膜炎，常见于艾滋病患者，另外也可以用来治疗耐阿昔洛韦单纯疱疹病毒性感染，有部分患有带状疱疹的患者也会用到膦甲酸钠氯化钠，但是一般情况下不会使用，临床上治疗带状疱疹仍以伐昔洛韦、阿昔洛韦为主来进行治疗，在以上药物治疗无效的情况下才会使用膦甲酸钠氯化钠。在使用膦甲酸钠氯化钠要注意监测肾功能，以免发生不良反应。