自然流产能否流干净，是有一定的概率的，根据流产的时期不同，其几率也有所不同。怀孕12周以内的流产为早期流产，此时孕囊附着常不牢靠，所以发生在12周以内的自然流产，绝大部分都能流干净。发生在12周以后的流产为晚期流产，此时胎盘附着已经牢靠，自然流产以后宫腔内可能还会有少量的残留物，所以就流不干净。建议女性在自然流产后，要密切观察阴道出血量的情况以及腹痛的症状。