子宫内膜异位症引起不孕的主要原因为影响女性排卵及精卵结合、着床发育。首先子宫内膜组织如在卵巢、输卵管等处出现异生，则可严重影响女性卵泡成熟及正常排卵。同时由于宫腔内部环境变化，精子无法存活并与卵细胞结合，即便成功结合，后期也可受影响出现胚胎发育异常甚至停育现象。另外除引起不孕外，患者一般还可出现月经期紊乱、腹部疼痛等症状。