三个月的宝宝咳嗽有点厉害可以在医生的指导下服药治疗，一般无痰咳嗽可以口服川贝清肺糖浆、氢溴酸右美沙芬糖浆等，有痰咳嗽可以口服鲜竹沥、小儿止咳糖浆等，如果宝宝的痰液比较粘稠可以口服氨溴索进行化痰，有可能伴随细菌感染或病毒感染，细菌感染可以口服抗生素进行治疗，例如阿莫西林、头孢克肟等，如果是上呼吸道普通病毒感染引起咳嗽，可以采取饮食治疗和对症处理，流感病毒引起的，可使用抗流感病毒的药物。