妊娠期女性三个月的时候最好做NT检查，因为NT检查可以筛查胎儿染色体异常的情况，是早期评估判断胎儿畸形的重要指标，也可以用于筛查唐氏综合征的胎儿。NT检查是通过B超测量胎儿颈后皮下组织内液体积聚的厚度，判断胎儿有没有出现发育畸形的情况。如果患者检查结果提示异常，需要后期进一步进行羊水穿刺检查，或者是无创DNA检查，明确胎儿的具体情况，出现畸形可能时，要终止妊娠。