男性染色体异常会有少精、无精的症状，会对人的生育造成影响，怀上后胎儿也容易发生自然流产，即使存活下来，胎儿多会存在生理上或智力上的缺陷。男性染色体异常时还容易增加胎儿患18三体综合症、先天性心脏病、肢体畸形的几率，孩子的听力和视力也多会受到影响。男性染色体异常在青春期就会有所表现，一般外阴部是正常的，但阴茎会比正常男性小，身体的体毛也比较少，胡须稀疏。