有少部分症状比较轻的腱鞘囊肿患者是可以自愈的，而且囊肿也会自行消退，不过这种可能性比较低。多数腱鞘囊肿患者都无法自愈，而且在确诊之后只能以对症治疗为主。对于囊肿比较小的患者，可以通过挤压的方式促使囊肿破裂，然后自行吸收。但如果囊肿是与关节腔相通的，不易破裂的时候，可以通过穿刺方法抽出囊液，然后加压包扎治疗。对于上述保守治疗方法均无效者，也可以选择手术切除腱鞘囊肿。