生殖健康管理师证书机构有很多，以下是一些常见的机构：

1、中国性健康教育协会：中国性健康教育协会是由国家卫生计生委主管的全国性社会团体，是中国性健康教育领域的权威机构之一，该协会开设了生殖健康管理师培训班，培养了大量的生殖健康管理师。

2、中国计划生育协会：中国计划生育协会是由国家卫生计生委主管的全国性社会团体，是中国计划生育领域的权威机构之一，该协会开设了生殖健康管理师培训班，培养了大量的生殖健康管理师。

3、各省市卫生计生委：各省市卫生计生委也会开设生殖健康管理师培训班，这些培训班通常由当地的医院或卫生机构主办，培养了大量的生殖健康管理师。

4、各大高校：各大高校也会开设生殖健康管理师培训班，例如北京大学、清华大学、复旦大学等知名高校都有相关的培训课程。