盐酸吗啉胍片对于治疗扁平疣是有一定的效果的，该药物在临床上主要适用于治疗流感病毒以及疱疹病毒感染引起的疾病，而扁平疣主要是由于人乳头瘤病毒感染引起的一种皮肤病，所以对扁平疣患者而言可以起到一定的抗病毒的作用的，但是如果想要治好扁平疣还可以选择水杨酸、干扰素凝胶、5%咪喹莫特乳膏以及氟尿嘧啶乳膏等药物治疗。另外，病情比较严重的患者，必要时也可以考虑进行手术治疗。