龟头内隐痛可能是因为患者平时不注意个人卫生、包皮过长，导致局部污垢堆积，细菌滋生，局部发生感染；或是使用碱性肥皂、避孕套刺激，局部受到摩擦、创伤，形成的龟头炎导致龟头局部的皮肤黏膜破损，所以感到疼痛；也可能是因为机体患有前列腺炎，支配龟头处的神经穿过有炎症的前列腺，则可有龟头隐痛的情况。患者平时需注意个人卫生，定时更换内裤，避免不洁的性生活。