去掉眼部的扁平疣可以在局部涂水杨酸、维a酸软膏、干扰素凝胶、咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶软膏治疗。患者使用药物没有效果的时候，还可以通过自体疣免疫疗法、激光、冷冻、电灼、刮除、光动力疗法治疗。患者这段时间要保持患处清洁，不要对局部进行挠抓，避免出现传染。如果手接触过患处，要及时洗手。饮食方面不要吃海鲜产品或辛辣的食物，建议患病期间要避免吸烟饮酒。