肛门坠疼首先要找出具体的原因，如果是痔疮引起的，可以使用高锰酸钾溶液坐浴，局部使用痔疮膏或痔疮栓进行治疗。如果是直肠炎、结肠炎等疾病引起的，可以在医生指导下服用一些消炎药进行治疗，如美沙拉嗪、左氧氟沙星、诺氟沙星等。如果是肛周脓肿引起的，可以局部使用红霉素软膏，同时口服甲硝唑等药物进行治疗。如果是情况较严重的患者，可能需要手术切开引流，然后使用消炎药预防感染。