患者发生急性腹泻的原因可以分为急性中毒、急性全身性感染以及急性肠疾病等。急性中毒中包括鱼胆、河豚等动物性中毒，桐油、毒蕈等植物性中毒，以及砷、有机磷等化学毒物中毒。急性全身性感染中包括副伤寒、败血症、霍乱、麻疹、副霍乱、伤寒等疾病。急性肠疾病中包括真菌性、病毒性、血吸虫性、细菌性以及阿米巴性急性肠感染或是嗜盐菌、沙门菌、金黄色葡萄球菌等细菌性食物中毒。