风湿免疫系统疾病病因复杂，可能是免疫系统功能紊乱、感染所致，或者与遗传因素有关，具体病因需要根据具体疾病来决定。首先如果是类风湿性关节炎，引起的病因有很多，例如家族遗传因素，如果患者的直系亲属患有类风湿性关节炎，患者患病概率大于正常人，同时微生物感染、长期吸烟也是诱发类风湿性关节炎的的因素之一。其次，如果是系统性红斑狼疮，也和遗传因素有一定的关，同时还和阳光、化学制剂等环境因素有关。