手足口病和水痘的病因是不同的，手足口病是由柯萨奇病毒、肠道病毒感染引起的，而水痘是由水痘-带状疱疹病毒感染引起的。它们皮疹出现的位置也不同，手足口病好发于手、足、臀、口腔等部位，而水痘多出现在胸、腹、背部，而四肢却比较少见，而且皮疹多是呈向心性分布的。手足口病的疱疹不痛不痒的，但水痘多会伴有瘙痒感。另外，手足口病痊愈后还可反复发作，但水痘患过一次后不会复发，可获得终身免疫。