小通草在临床上具有清热、利水、通乳的功效，主要治疗小便黄赤、急性膀胱炎、尿少、水肿、肾炎以及热病烦渴等病症。一般治疗小便黄赤时，可以用小通草配合木通、车前子一起煎服；治疗急性膀胱炎，可以用小通草和车前子、地肤子一起煎服。小通草还可以用于湿热内蕴、淋沥涩痛病症，但是作用可能缓慢，可以和木通、滑石等一起煎服。如果身体有气阴两虚、中寒的人群，是不建议服用小通草的。