临床上亚急性甲状腺炎一般多是由于病毒感染引起的甲状腺急性炎症病变，大多数患者是可以自愈的，但是部分患者会有一过性甲状腺功能减退的症状，所以如果患者的全身症状比较轻，这时候可以在医生指导下口服消炎止痛类的药物进行治疗，比如阿司匹林或者吲哚美辛肠溶片。其次也可以使用对乙酰胺基酚或者水杨酸盐来控制症状，另外，疼痛症状比较剧烈的患者也可以使用非类固醇抗炎药，或应用糖皮质类固醇激素如泼尼松可迅速缓解临床表现。