每天早上醒来肚子疼拉肚子有可能是腹部受凉、睡觉前吃生冷寒凉的食物、慢性肠炎、脾胃虚弱、结肠炎、肠道功能紊乱、肠易激综合征、吃不干净的食物、肾阳虚、脾胃虚寒等导致的。建议最好去做粪便常规检查，如果是脾胃虚弱引起的，可以在医生的指导下用补脾益肠丸治疗。患者出现结肠炎的时候，可以在医生的指导下用强的松龙、奥沙拉嗪、美沙拉嗪等药物治疗。患者平时最好吃低脂和少渣的食物。