巧克力囊肿属于女性常见疾病，如果不及时治疗，可能会影响怀孕。巧克力囊肿是子宫内膜异位症中的一种类型，如果囊肿较大，会压迫卵巢或者周围组织，一旦压迫到输卵管，则会影响怀孕。此外，巧克力囊肿还可能会引起盆腔黏连，出现输卵管黏连的情况，也容易造成不孕。建议及时去正规医院妇科就诊，进行相关治疗。平时需要注意个人卫生，保持生殖部位的清洁卫生。