男性龟头长水泡并伴有疼痛的感觉，可能是患者身体比较虚弱时，受到细菌的侵袭后发生感染出现龟头炎的症状，某些患者包皮过长导致被包裹的龟头不能得到彻底清洁时，也会出现炎症反应，需要及时去医院进行检查，明确诊断后可以在医生指导下服用消炎止痛药物减轻症状。患者受到疱疹病毒的侵袭后也会出现龟头水泡、局部疼痛并伴有全身发热、头痛的症状，可以进行抗病毒治疗。