替硝唑和甲硝唑都是硝基咪唑类抗生素，二者最大的区别是在临床应用，因为甲硝唑的不良反应要比替硝唑大，主要表现为严重的消化道反应。所以甲硝唑被列为2B类致癌物，临床主要用于预防和治疗厌氧菌感染导致的局部感染。而替硝唑由于副作用较少，临床主要用于治疗各种厌氧菌感染导致的疾病，如妇科阴道感染、盆腔感染、呼吸道感染、败血症等。价格上替硝唑也比甲硝唑要贵些。