子宫腺肌症的病因尚不明确，可能是子宫肌壁损伤导致的，与多次妊娠分娩或是子宫手术操作不当有关。子宫腺肌症的发生还考虑是子宫内膜基底层细胞增生、侵袭，周围肌层细胞代偿性肥大增生引起的。若是患有卵巢功能失调，体内雌性激素增高刺激子宫内膜增生，引起子宫内膜增生过快，这也多会引起子宫腺肌症。另外，从中医上认为子宫腺肌症多是由气滞、寒凝、气虚、肾虚引起的。