长期使用板蓝根会导致体质发生变化，因为板蓝根属于寒性的药材，长期使用会出现胃疼、食欲不振、怕冷、腹泻、以及消化不良等相关症状，反而会使身体虚弱、免疫力下降。如果随意使用板蓝根，若不能对症治疗很可能会导致患者病情加重，因此在临床治疗上，需要根据患者的疾病症状进行合理使用。然而对于支原体，衣原体感染的疾病，使用板蓝根治疗是没有效果的。针对特殊体质的患者，板蓝根还会诱发过敏，出现头昏、眼花、气短、呕吐、心慌、皮疹等症状。