A群流脑疫苗和AC流脑疫苗的区别主要是预防效果和接种年龄等方面不同，A群流脑疫苗和AC流脑疫苗均属于流脑疫苗，A群流脑疫苗多数是用于预防A群脑膜炎双球菌造成的流行性脑脊髓膜炎，通常在出生六个月到十八个月之间需注射，并且两剂注射的时间需间隔三个月；而AC流脑疫苗多数是用于预防A群和C群脑膜炎球菌感染，常常需超过两周方可接种，同时两剂疫苗注射的时间需间隔三年以上。