新生儿先天性巨结肠一般是可以治疗好的。治疗方案需根据患儿的症状来决定。一般轻症的患儿，临床上一般采用保守治疗，包括1.维持营养及水电解质平衡，不能进食者，需要给予静脉营养；2.控制感染，有感染者，需要及时的进行抗感染治疗；3.使用开塞露或者缓泻剂，让患儿能每天或者两天就排一次便。有严重症状的患儿，一般采用手术治疗，包括1.结肠造瘘术；2.根治手。经过治疗后，遵医嘱定期进行复诊。