腋下囊肿是否会自己消失，主要还是要根据囊肿的体积以及有没有存在局部感染病和患者自身吸收能力等因素进行具体分析，例如腋下囊肿体积小，患者吸收能力好，同时也不存在局部感染的现象，那么此种情况具有自己消失的可能性，但对于腋下囊肿体积小，患者吸收能力差已经出现明显的局部感染症状，此种情况通常是不会自己消失的，患者需要积极配合医生进行控制感染治疗，必要时再进行手术治疗。