女性吃褪黑素的副作用是可能会导致内分泌失调，褪黑素是松果体产生的一种激素，长期服用这种激素对于人体的激素水平有影响，可以扰乱正常激素水平状态，释放过多的泌乳素，对于生育能力造成影响，严重情况下可以导致女性不孕。经常吃褪黑素可能会引起发胖，这种激素性肥胖比较顽固，想要减肥比较困难。长期补充褪黑素会产生依赖性，一旦停用就可能会烦躁不安、焦虑、易怒。