如果有溃疡性直肠炎，患者使用美沙拉嗪等药物进行直肠给药的治疗，也可以联合糖皮质激素进行保留灌肠治疗疾病。如果是感染引起的直肠炎，有细菌感染可以使用头孢菌素等抗生素类药物治疗，有病毒感染可以使用阿昔洛韦等抗病毒的药物治疗。患者也可以使用双歧杆菌活菌制剂等益生菌制剂调理胃肠道菌群，辅助治疗直肠炎。如果为嗜酸细胞性直肠炎，可以使用抗组胺药物、糖皮质激素等治疗。