慢性萎缩性胃炎治疗一般以去除病因及治疗原发疾病为主，且该病一般无法治愈，需进行长期治疗。患者可合并使用质子泵抑制剂、H2受体阻滞剂、胃黏膜保护药、促胃肠动力药、抗生素等进行治疗。此外，如患者合并有上皮内瘤变，则还应进行手术剥除损伤黏膜或直接切除损伤严重组织。患者日常也需注意调整饮食，不可食用辛辣刺激及各类腌渍食物，应适当多饮水食用蔬菜水果。