大便后引起肛门疼痛的原因较多，常见的病因包括以下：一、肛裂，由于大便过于干硬，排便时较费力，在用力排便时会导致肛门皮肤裂开，从而出现排便出血及疼痛的现象。二、痔疮，由于平时不良生活习惯及饮食习惯导致出现便秘，当痔核肿大或充血时会出现瘙痒及疼痛的现象。三、腹泻会导致肛门周围皮肤变脆弱，当再次受到粪便或尿液刺激出现肛门疼痛的现象。其次肛周脓肿及肛门息肉等疾病也会引起肛门疼痛。