部分跖疣会出现自愈的现象，但如果男性出现明显不适症状，或是出现皮损多发现象，可以在医生指导下外用水杨酸、维A酸等药物治疗，也可以选择具有抗病毒功效的药物治疗，例如干扰素、咪喹莫特等药物。如果病症较重也可以联合口服药物，或通过激光、电灼等方式治疗跖疣。在治疗期间患者也要多注意个人卫生，要保持足部清洁干燥，同时也要避免对患处进行抓挠。