通过激光手术来治疗近视的患者，最容易存在的后遗症是屈光回退，即手术过后的一段时间会出现视力下降的现象。另外有矫正不足的现象，如术后仍有残留的度数，但可以根据情况再次矫正。有部分患者会在术后6个月内，对光线会比较敏感度，但是之后会慢慢消失。此外，就是术后的感染，但是不常见，多由于术中或者术后不卫生导致。还有一些少见的副作用有眩光、复视、表皮愈合不良、角膜瓣下杂质及泪水分泌等。