半夜的时候肚子疼有可能是晚上睡觉前进食过多生冷刺激性食物或腹部受凉引起的肠痉挛现象。也有可能是由于急性肠炎、细菌性痢疾引起的。还有可能是由于阑尾炎、结肠炎、肠易激综合症引起的。此外腹部疼痛也不排除是和膀胱炎、胆囊炎、慢性活动性肝炎、胰腺炎等疾病有关。建议您去医院做腹部彩超或者是腹部ct检查，明确诊断。对于急性肠炎引起的腹部疼痛，可以在医生指导下口服消炎药物治疗。