金霉素眼膏和红霉素眼膏的区别在于：首先，二者的类别不同，金霉素眼膏属于四环素类抗生素，而红霉素眼膏属于大环内酯类抗生素；其次，金霉素眼膏和红霉素眼膏的作用效果不同，金霉素眼膏的抗菌作用要强于红霉素；第三，安全系数不同，由于红霉素的抗菌作用较弱，因此安全性更高，副作用较少；第四，成分不同，金霉素眼膏的主要成分为金霉素，红霉素眼膏主要成分为红霉素。