吃完避孕药肚子疼，可能是药物的副作用，也可能是因为疾病引起的。因为避孕药可能会使女性体内的激素水平发生改变，引起子宫异常收缩，从而引起肚子疼。也可能是因为避孕药中的某些成分对肠胃道产生刺激引起的。还可能是患者本身患有妇科疾病引起的。建议女性平时不要过于频繁的使用避孕药，避免对身体造成无法挽回的伤害。不打算要孩子的女性可以利用好安全期，因为这个时候怀孕的几率比较低，但是也要做好避孕措施。