孕妇甲减对胎儿影响很大，在孕早期母体的甲状腺激素水平不足，会影响胎儿大脑以及全身的正常发育。怀孕三个月后胎儿的脑发育主要依靠胎儿自身产生的甲状腺激素，如果胎儿时期甲状腺激素水平不足，会导致胎儿骨骼和大脑的发育会停滞，出生后容易出现身体矮小、智力低下，增加患有呆小症的风险。对于母体来说，妊娠期合并甲减，还会增加先兆子痫、胎盘早剥等疾病发生率。