冷冻治疗皮肤疣是存在一定疼痛的。皮肤疣为人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，可导致机体皮肤的基底层上皮细胞出现异常分化及增生，故可形成突出于体表的赘生物。因冷冻治疗方法的原理为液氮极速冷冻疣体使其坏死脱落，故可能导致周围局部皮肤出现一定的应激反应，遂一般存在疼痛。如患者对手术过程中的疼痛难以忍受或有其他不宜手术因素，则也可选择使用咪喹莫特等外用药物治疗皮肤疣。