小便时出现尿液颜色偏深褐色的现象主要有以下几种原因：1、长时间憋尿的情况下尿液被肾小管重吸收或者是饮水量较少、体液大量丢失都会导致尿液浓度比较高，尿液的色泽发黄，就会出现颜色偏深、偏褐色的现象。2、患有慢性肝炎、肝硬化等肝脏疾病的情况下，患者的肝脏受损，尿液中的胆红素含量就会不断上升，导致尿液严重发黄。3、患有膀胱结石、肾结石等泌尿系统结石或者是尿路感染等泌尿系统感染的情况下，患者会出现血尿的现象，也会引起尿液变成深褐色。