男性小便时感觉到疼痛，主要考虑是泌尿系统疾病导致的，如尿路感染、尿路结石、膀胱炎、膀胱结石、尿道损伤等，也可能是前列腺炎、前列腺增生等疾病导致的，还可能是上火导致小便痛。建议出现小便时疼痛感觉的患者，最好去医院泌尿外科详细的检查一下。如果是泌尿系统感染，可以使用抗生素类药物进行治疗。如果是泌尿系统结石，可以使用排石的药物进行治疗，必要时可以选择手术治疗。