怀孕41天是否可以做人流，还需要根据具体情况来定，例如孕妇身体状况良好，在进行彩超检查时发现孕囊不大，只有一至两厘米，则可以进行人流手术。而如果彩超检查提示孕囊过小，在一厘米以下，则不建议进行人流，避免出现流产不全的情况。建议人流后的女性一定要注意休息，避免过早下床活动和过性生活，同时还要注意好下体卫生，饮食以清淡为主，一周左右再去医院进行复查。