经期结束后两三天内阴道有褐色分泌物可能是由于月经出血没有完全干净引起的，一般情况下在经期结束后一周以后都可以自然消失，女性不必过于担心。如果是在两次月经中间出现了褐色分泌物，考虑是由于排卵期出血导致的，女性在排卵期时由于体内激素水平的变化会导致子宫内膜脱落，出血暂时性的出血也是正常的生理现象。如果性生活后出现该现象或同时伴下腹部疼痛等症状时，则考虑女性有可能出现了宫颈息肉或盆腔炎等妇科病变。