唐氏筛查和无创DNA检查首先筛查出异常的准确率不同，唐氏筛查结果的准确率大概在60%-70%左右，但是无创DNA检查结果的准确率大概在98%-99%左右；其次，两者检测项目不同，唐氏筛查主要是抽血检查血清中游离雌三醇、人绒毛促性腺激素和甲胎蛋白浓度，结合孕妇的体重、年龄、采血孕周以及预产期判断发生唐氏综合征和开放性神经管畸形的危险系数；无创DNA检查主要是从孕妇血液中分离出胎儿的DNA进行检测，确定胎儿有无染色体异常。