尖锐湿疣可以通过治疗清除外在病灶，达到临床治愈的标准，但一般不能根治，容易复发。目前临床上治疗尖锐湿疣，一般以院内治疗、以及院外治疗为主；院外治疗常用的有咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素软膏等外用药，对于治疗尖锐湿疣轻症效果较为明显。院内治疗通常使用稀释的三氯乙酸溶液局部用药，还可使用冷冻、微波、激光、电凝等物理疗法进行破坏治疗，清除外在的皮损。如果范围较大、以上手段治疗效果不佳，也可使用手术进行治疗。