导致女性每天早上醒来后腰疼的原因有很多，最常见的是夜间吹空调没有盖好被子，导致腰部血液循环不畅，因此就会出现腰疼的症状。或者是因为患者近期过度劳累导致腰部软组织受损，引发一些腰椎疾病等导致的腰部疼痛。经期腹痛也是女性出现腰痛的常见原因。另外，一些泌尿系统疾病和肾脏疾病或妇科疾病也可导致女性出现腰疼的症状，常见的有尿路结石、肾结石、盆腔炎等。患者如果短时间内症状没有好转，最好及时去医院进行就诊。