孩子突然发烧39度但是没有感冒症状多考虑是在病毒感染的早期，症状还没有来得及出现。出现这种情况还考虑是疱疹性咽狭炎或是扁桃体发炎等疾病引起的，也有可能是急性肠胃炎或是上呼吸道感染等疾病导致的，可以到医院做血常规等检查，了解病因后对症进行治疗。当孩子发烧39摄氏度时，需要及时给予退热药治疗，同时配合物理降温处理，防止惊厥或抽搐的情况发生。