怀孕三个月内的流产方法主要有三种，具体用哪种方法要看怀孕时间，若是怀孕没有满49天，可以遵医嘱服用流产药物，如米非司酮进行流产，若是宫腔内有残留物还可以通过清宫术的方法治疗，若是超过49天没满70天可以通过人工流产手术的方法终止妊娠，但若是怀孕吃超过七十天，在三个月内此时胎儿发育的较为成熟，若是想终止妊娠，建议入院进行引产，在流产后需要多补充营养，加快子宫恢复。